Одной из важных особенностей плавленого сыра является способ его плавления. Благодаря использованию эмульгирующих солей плавленые сыры имеют однородную структуру, а жиры и белки хорошо перемешаны в сыре. В результате жир не отделяется от сыра, а располагается на нем отдельным слоем. Это одна из причин, по которой плавленый сыр часто используют в замороженном виде в таких блюдах, как пицца, лазанья и т. д.